1. Văn phòng Hội đồng quản trị
  2. Văn phòng Ban quản lý dự án Long Thành
  3. Văn phòng Tổng công ty
  4. Văn phòng Đảng - Đoàn
  5. Ban Tài chính - Kế toán
  6. Ban Tổ chức - Nhân sự
  7. Ban Kế hoạch - Kinh doanh
  8. Ban Kết cấu hạ tầng - Môi trường
  9. Ban Pháp chế
  10. Ban Kỹ thuật - Công nghệ
  11. Ban An ninh - An toàn
  12. Ban Khai thác cảng