Nhằm bảo đảm an toàn sức khỏe cho hành khách và cán bộ, nhân viên trước diễn biến phức tạp của dịch bệnh Covid-19, Cảng hàng không Buôn Ma Thuột thực hiện nghiêm các chỉ đạo của Chính phủ, Bộ GTVT, Bộ Y tế và của Tổng công ty Cảng hàng không Việt Nam về công tác phòng chống dịch, thực hiện nghiêm Quy trình khai thác bảo đảm an toàn cho hành khách đi máy bay trong giai đoạn dịch Covid-19. Tất cả hành khách đều phải đo kiểm tra thân nhiệt, bắt buộc đeo khẩu trang trong suốt thời gian có mặt tại nhà ga, thực hiện giãn cách, rửa tay sát khuẩn trước khi vào nhà ga.

Trong 02 ngày 13-14/8/2020, Cảng HKQT Tân Sơn Nhất đã tổ chức phục vụ an toàn 3 chuyến bay của Vietnam Airlines và Vietjet đưa khoảng 700 hành khách bị mắc kẹt vì thực hiện cách ly dịch bệnh tại Đà Nẵng trở về Thành phố Hồ Chí Minh.

Từ ngày 12/8 - 14/8/2020, Cảng HKQT Đà Nẵng phối hợp chặt chẽ với các hãng hàng không và các cơ quan, đơn vị liên quan phục vụ an toàn, chu đáo các chuyến bay chở 1.450 khách du lịch bị mắc kẹt tại Đà Nẵng do thực hiện giãn cách xã hội  về Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh. Tất cả hành khách, phi hành đoàn sau khi trở về phải thực hiện các biện pháp giám sát, cách ly y tế tại địa phương theo quy định.